正确答案：C

答案解析：生物威胁指的是对人类健康、生态系统或农业造成的潜在危害，这些危害与生物因素有关。以下是选项的分析：

A.各种致病微生物、转基因生物

致病微生物如细菌、病毒等可以引起疾病，对人类健康构成威胁。转基因生物可能带来不可预见的生态后果，也可能对人类健康产生影响，因此它们可以被认为是生物威胁的来源。

B.外来生物入侵

外来生物入侵是指非本地的生物物种被引入到新的生态系统，并可能对当地的生物多样性和生态平衡造成破坏，对人类活动也可能产生负面影响，因此属于生物威胁的来源。

C.工厂烟囱排放的空气污染

空气污染主要指的是化学物质污染，这些物质可能对人类健康和环境造成危害，但它们不是生物因素，而是化学或物理因素，因此不属于生物威胁的来源。

D.生物恐怖事件

生物恐怖事件是指故意使用生物制剂（如病原体）进行恐怖袭击，对人类健康和国家安全构成威胁，因此属于生物威胁的来源。

正确答案是C：工厂烟囱排放的空气污染，因为它不是直接的生物因素，而是化学或物理因素造成的污染。